Ocitáme sa na farme manželov Van De Kampovcov na vidieku v Montane. Pán Van De Kamp ručne z dreva vyrezal niekoľko malých bizónov a teraz ich maľuje bielou farbou. Jeho manželka nechápe prečo by sa niekto len tak vzdal dieťaťa. Jej manžel ju uistí, že Boh na to má svoje dôvody. K farme prichádza auto, z ktorého vystúpi pracovníčka adopčnej agentúry. Pani Van De Kampovú ubezpečí, že pre slobodnú matku dieťaťa to bolo veľmi ťažké rozhodnutie, no rozhodla sa tak pre chlapcovo dobro. Z auta k nim pristúpi pracovníčkina kolegyňa a pani Van De Kampovej do náručia odovzdá malého chlapca, ktorého sa Van De Kampovci rozhodli adoptovať. Je ním Scullyovej syn William.

O týždeň predtým Scullyová s Williamom v aute prichádza domov. Niekto ju sleduje. Doggett neskoro večer opúšťa kanceláriu Aktov X a dovnútra tajne vstúpi znetvorený muž, ktorý predtým sledoval Scullyovú. Doggett si spomenie, že v kancelárii zabudol spis a vráti sa späť. Muž ho napadne, dotlčie a uteká preč, no Doggett ho na chodbe dostihne a zadrží ho. Spolu s Reyesovou skoro ráno zavolajú Scullyovú. Muž sedí vo vypočúvacej miestnosti. Tvrdí, že sa volá Daniel Miller a stal sa obeťou konšpirácie. Scullyová s Reyesovou vstúpia do vypočúvacej miestnosti, v ktorej Doggett Scullyovú informuje, že muž sa dnu do budovy FBI dostal vďaka vstupnej karte, ktorú mu podľa jeho vlastných slov dal Fox Mulder. Muž tvrdí, že sem prišiel hľadať odpovede na to, čo mu urobili. Vraví, že ho sem poslal Mulder a povedal mu, že na tom, čo sa mu stalo sa podieľali ľudia kryjúci tajné vládne sprisahanie, no viac Scullyovej neprezradí, lebo Mulder si vraj neželá, aby ho našla. Doggett jej ukáže spisy, ktoré muž vzal z kartotéky a je medzi nimi i fotka Muldera a jeho sestry Samanthy. Muž pozná všetky detaily jej únosu.

Scullyová muža v Akadémii FBI podrobí celkovému lekárskemu vyšetreniu. Jazvy má nielen na tvári, ale i po celom tele. Scullyová mu z tváre sňala jeho umelý nos i uši a dala mu dolu parochňu, ktorá zakrývala mužovu nepekne spálenú pokožku. Zdá sa, že muž je na tom ešte horšie ako sa pôvodne zdalo. Scullyová zhodnotí, že popáleniny nevyzerajú byť od ohňa či kyselniny a muž jej vysvetlí, že mu podali nejakú injekciu a snažili sa z neho vytvoriť prototyp mimozemského replikanta, ale zlyhali a Scullyová teraz na vlastné oči môže vidieť ako ho zohavili. Doggett Scullyovú zavolá von na chodbu. Zistil, že muž im udal nepravú totožnosť. Má istú teóriu, no nevie, či by mu Scullyová uverila: myslí si totiž, že muž sa s Mulderom nepoznal, tak ako tvrdí, ale že je to Mulder osobne. Scullyová mu prirodzene neverí, je si istá, že keby to bol Mulder spoznala by ho.

Scullyová mužovi odoberie vzorku krvi a muž si v mysli spomenie na bolestivé testy, ktorým ho podrobili. Scullyovej sa pýta, či mu pomôže a tí, čo mu to urobili za to zaplatia. Scullyová nevie koho tým myslí. Muž jej povie i o jej únose a vie, že na nej tiež robili testy. Scullyová sa ho pýta na jeho pravé meno, ale muž sa bojí, že keby sa istí ľudia z FBI dozvedeli, kde je, zabili by ho -- rovnako ako by zabili i Muldera -- a preto jej o sebe už viac povedať nemôže, i keď podotkne, že jej môže pomôcť. "I vy hľadáte odpovede," vraví muž a Scullyovej zblízka v oku uvidíme odraz Mulderovej tváre. "Obaja hľadáme odpovede," povie Mulder a Scullyová si na okamih rukou prejde po tvári, znepokojená z toho, čo práve videla alebo čo si myslela, že videla. Vonku Doggettovi a Reyesovej povie, že si je istá, že muž nie je Mulder a presvedčia sa o tom i oni dvaja hneď potom, ako Doggett získa výsledky testu DNA. Reyesová sa jej pýta na ďalší postup. Scullyová vie, že muž klame a musia zistiť prečo a predovšetkým čo chce. Navrhne, aby ho v tichosti previezli naspäť do Washingtonu.

Agenti muža vezmú späť do kancelárie Aktov X, v ktorej sa cudzinec zahľadí na ceruzky zabodnuté do stropu. Agentom povie, že pred pár rokmi došlo k zániku konšpirácie na zakrytie pravdy o existencii mimozemského života, no vzišla z nej nová konšpirácia, ktorej vykonávateľmi sú mimozemšťania samotní. Chceli z neho vytvoriť replikanta, ale nevyšlo im to a on ich teraz chce odhaliť, aby tak ako on nedopadli i ďalší ľudia. Vraví, že spisy, o ktorých mu Mulder povedal v kartotéke nie sú - niekto ich odtiaľ musel vziať. Scullyová vie, o akých spisoch hovorí. Zájdu k nej do jej bytu a Scullyová spisy vytiahne zo skrine. Práve dokázala, že muž klame, lebo spolu s Mulderom sa dohodli, že tie spisy pre istotu nebudú držať v kartotéke, ale schovajú ich u nej doma. Mulder vedel, kde tie spisy sú, vedel, že neboli v kancelárii Aktov X. Vtom agenti začujú Williamov plač a znetvoreného muža nájdu stáť nad Williamovou kolískou. Mulder mu vraj rozprával o tom ako veľmi mu William chýba. Scullyová si Williama vezme do náručia a muža sa pýta na Muldera a kde by ho našla. Muž vraví, že s tým čo sa stalo už nič nenarobí a vie, že to bolo Mulderovo rozhodnutie. Sám Mulder ho požiadal, aby jej nepovedal, kde by ho našla. Scullyovej sa opýta, či by si Williama nemohol podržať v náručí -- pre Muldera. Scullyová nevie, ako si to má vyložiť, no po chvíľke zaváhania dá Williama mužovi do náručia a Williamovi na líco kvapne cudzincova slza.

Doggett zájde za Skinnerom. Muž má síce rovnakú krvnú skupinu ako Mulder, no je od neho nižší a má nižšiu váhu. Doggett usudzuje, že mužovi ide o pomstu za to, čo mu urobili. Prečo by však Mulder muža posielal do kancelárie Aktov X po spisy, ktoré aj tak pozná naspamäť? Muž si zatiaľ dané spisy prezerá u Scullyovej v jej byte. Scullyová mu neverí a chce konečne počuť pravdu. Muž vie, že je to pravda, ktorú chcú počuť obaja a vie, aký ťažký život musí Scullyová žiť, bez toho, aby mala istotu či Muldera ešte vôbec niekedy uvidí. Scullyová od neho chce vedieť odkiaľ to všetko o nej vie. Muž jej povie, že vie všetko čo vie Mulder. Vie, že Scullyovú využili k tomu, aby splodila dieťa a teraz ju využívajú k tomu, aby sa oň starala a vychovávala ho. Vie, že jej syn je sčasti mimozemšťan - a vie to i ona sama. Dnu do izby vstúpi Reyesová a po nej Doggett, ktorý Scullyovej povie čo sa práve dozvedel od Skinnera: že test DNA potvrdil, že mužova DNA sa zhoduje s Mulderovou.

Scullyová je zmätená i zhrozená zároveň a muž chvíľku nepozornosti využije k tomu, aby utiekol. Doggett ho dobehne a zadrží ho, no nevšimne si, že muž v uličke niečo zodvihol zo zeme. Reyesová mužovi podá prášky na spanie. Scullyová tomu stále neverí. Muldera pozná lepšie ako akýkoľvek test a keby to bol on spoznala by ho. Reyesová chce, aby sa na chvíľu zamyslela nad tým, aké to pre Muldera musí byť, pomyslenie na to, ako vyzerá. "Ak by to bol Mulder, bolo by mi to jedno," vraví Scullyová. Mulderovi to však jedno byť nemôže, vraví Reyesová. Mulder sa možno hanbí za to, že odišiel a ju nechal chrániť Williama a pritom sa nepostaral sám o seba, vraví Doggett. Znetvorený muž zatiaľ vo vedľajšej izbe z úst vykašle prášky, ktoré mal prehltnúť, vstane a cez chodbu okolo Mulderovho akvária kráča k Williamovej izbe. Z vrecka si vytiahne injekčnú striekačku a malú fľaštičku, ktoré si predtým schoval vonku na ulici. Agenti začujú Williamov plač. Bežia do izby a Scullyová si Williama zoberie do náručia. Muž si ľahol naspäť do postele akoby sa nič nestalo, avšak Scullyová zisťuje, že William krváca a je jasné, že muž mu niečo urobil.

Scullyová a Reyesová Williama vezmú na pohotovosť. Scullyová má strach, doktorom povie, že je lekárka a chce ostať s Williamom, no doktorka z pohotovosti ju uistí, že o Williama sa postarajú a nemá sa čoho báť. Doggett zatiaľ v posteli, na ktorej muž ležal nájde injekčnú striekačku. Doktorka na pohotovosti agentkám po vykonaní testov oznámi, že Williamovi nič nie je. Je v poriadku, toxikologický test ukázal len zvýšenú hladinu železa v krvi. Reyesová tomu nerozumie, ale Scullyová to práve teraz všetko pochopila.

Odchádza do vypočúvacej miestnosti za znetvoreným mužom. Ten si myslí, že aspoň na okamih uverila tomu, že je Mulder, i keď Scullyová to poprie. "Chceli ste tomu uveriť," vraví neznámy muž. Scullyová mu povie, že by sa stavila, že si celý ten čas prial, aby ho tá guľka, ktorá ho mala zabiť naozaj zabila. "Keď na mňa v tej kancelárii vystrelil, mohol mi zničiť moju tvár a česť, ale nemohol zničiť to, čo mám najradšej -- to, ako ho nenávidím," vraví znetvorený muž a v pohľade späť uvidíme ako Muž s cigaretou v kancelárii Aktov X (v epizóde "One Son" 6x12) vytiahol zbraň na svojho syna, Jeffreyho Spendera, ktorý teraz v prítomnosti sedí pred Scullyovou. Scullyová vie, koho tým myslí a Spender dodá, že Muž s cigaretou je i Mulderovým otcom. Spender sa spoliehal na to, že Scullyová mu uverí na základe vzorky DNA, lebo to je to jediné, čo mali s Mulderom spoločné -- veď sú nevlastní bratia. Scullyová háda správne, že Spenderovi po celý čas šlo o jediné -- aby sa dostal k Williamovi. Zistila, že Spender Williamovi do tela vpichol neznámy kov. Spender upresní, že to bol magnetit. Mužovi s cigaretou šlo o to, aby mohol kontrolovať celý proces kolonizácie. Keď mu to nevyšlo zavrhol na celý svet. Spenderovi ide o pomstu, kolonizácii sa chce postaviť na odpor. Preto Williamovi podal injekciu, po ktorej je z neho obyčajný chlapec. Podľa Spendera sa tým zamedzilo celej kolonizácii, ktorej mal William stáť na čele, i keď sily, ktoré ho potrebujú k nastoleniu svojej nadvlády si to nikdy nepripustia. Scullyová si myslí, že ho dokáže ochrániť, ale Spender má pravdu, keď o tom zapochybuje. "Pozrite sa na mňa -- na to čo mi urobili. Je to to, čo chcete pre svojho syna?" pýta sa.

Scullyová neskôr u seba doma stojí nad Williamom, ktorý leží vo svojej kolíske. Reyesová vie, že sa nedá nemyslieť na to, čo jej Spender povedal, no myslí si, že to všetko boli klamstvá. Scullyová na druhú stranu vie, že si tým nikdy nemôže byť istá. Riziko je privysoké. Nahrnú sa jej slzy do očí. Hovorí, že nechce, aby jej syn svoj život prežil v strachu, no ona sama by mu taký život nikdy, ale nikdy sľúbiť nemohla. "Ale kto by mohol?" pýta sa jej Reyesová. Scullyová sa dotkne hviezdy visiacej z hračkárskeho kolotoča ponad Williamom a prepukne v plač.

Nasleduje strih do domu manželskej dvojice z úvodu epizódy. Manžel práve dokončil ručnú výrobu kolotoča ponad Williamovu kolísku. Manželia Williama uložia k spánku a my ho potom uvidíme ako potichu leží v kolíske a kamera zblízka zaberie dreveného bieleho bizóna, ktorý visí ponad Williamovou kolískou v jeho novom domove.