MULDER V UTAJENÍ PRENIKÁ DO OZBROJENEJ TERORISTICKEJ SKUPINY, KTORÁ DISPONUJE SMRTIACIM PATOGÉNOM, KTORÝ V ICH RUKÁCH PREDSTAVUJE NEBEZPEČNÚ ZBRAŇ.
Mulder, Scullyová, Skinner a tucet ďalších agentov sa v parku vo Washingtone zúčastnia na tajnej operácii. Cieľom tejto operácie je zadržať Jacoba Haleyho, člena teroristickej skupiny. Kým Scullyová a Skinner sledujú priebeh udalostí v parku zo špeciálne vybavenej dodávky, Mulder spolu s ostatnými agentmi čakajú na Haleyho príchod vonku. Haley prichádza a sadne si na lavičku hneď veľa neznámeho muža. Haley mužovi podá obálku a potom sa rýchlo dá na útek, pričom kričí, že mužovi nie je dobre. Mulder sa pustí bežať za Haleym, pričom nevie o tom, že tvár a ruky muža sediaceho na lavičke napadla neznáma látka rozkladajúca tkanivo. Scullyová o tom vie a preto vyskočí z dodávky a beží varovať svojho kolegu. Dostihne Muldera, ktorý jej povie, že podozrivý mu utiekol. Scullyová je šokovaná, lebo len pred chvíľou videla, ako sa Mulder s Haleym rozprával a nechal ho utiecť.
Neskôr v kancelárii v FBI sa Scullyová Muldera pýta na to, prečo podozrivého nechal utiecť, no Mulder sa vyhne jej pohľadu aj odpovedi na jej otázku. Agenti sa zúčastnia stretnutia členov rôznych vyšetrovacích agentúr, ktorí sa spojili preto, aby nebezpečného Haleyho chytili. Scullyová tvrdí, že muža na lavičke zabil neznámy patogén, ktorý predstavuje biologickú zbraň. Skinner všetkým ukáže fotografiu Augusta Bremera, šéfa teroristickej skupiny, ktorej členom je aj Haley. Tvrdí, že obaja Bremer a Haley súperia o post šéfa skupiny.
Scullyová sa rozhodne tajne sledovať Muldera. Mulder prichádza do motelovej izby, v ktorej zodvihne telefón a cez telefón sa rozpráva s Haleym. Vyzerá to akoby obaja pracovali spolu. Čoskoro pred motel prichádza auto, do ktorého Mulder nasadne a auto odchádza. Scullyová auto sleduje, no z cesty ju vytlačia dva sedany. Zo sedanov vystúpia štyria muži a pristúpia k jej autu.
Muži neskôr Scullyovú sprevádzajú do vládnej budovy, v ktorej sa ku svojmu nemalému prekvapeniu stretne so Skinnerom a agentom Leamusom, ktorí velia operácii. Žiada od nich vysvetlenie ohľadom Muldera. Oni jej vysvetlia, že Mulder pracuje v utajení a snaží sa trikom dostať sa dovnútra skupiny. O jeho úlohe vedia iba Skinner a Leamus. Niekto zo skupiny Muldera kontaktoval potom, ako si vypočul jeho názory na vládne praktiky na konferencii o UFO.
Muldera zatiaľ vysadia na opustenej farme. Tam ho spovedá Haley, ktorý ho obviní z toho, že ich oklamal. Mulder tvrdí, že sa mýlia, no Holohlavý muž mu schytí jeho malíček a začne mu ho vytáčať do strany, čím Mulderovi spôsobí silnú bolesť. Mulder v bolestiach tvrdí, že v skupine musí existovať zradca, ktorý vynáša informácie, ale on ním nie je. Holohlavý muž zatlačí silnejšie a Mulderovi zlomí malíček. Haley ukončí vypočúvanie so slovami, že Mulderovi verí. Zatiaľ Bremer otestuje účinky patogénu v malom mestskom kine, pričom tam zabije 14 ľudí. Otázkou zostáva, ako sa patogén preniesol na všetkých ľudí v kine.
Mulder sa vracia do svojho bytu, kde ho prekvapí Scullyová. Povie mu, že vie o tom, akú má Mulder úlohu a postará sa mu o jeho zlomený malíček. Nevedia však o tom, že ich konverzáciu odpočúva Bremer. Neskôr Mulder podáva správu Skinnerovi a Leamusovi. Tvrdí, že skupina sa chystá vylúpiť banku. Mulder takisto tvrdí, že Haley si od neho vyžiadal informácie o jednotlivých členoch skupiny, ku ktorým má Mulder ako agent FBI prístup. Leamus povie, že to predpokladal a Mulderovi podá mikrofilm s danými informáciami. Muldera následne opäť zavezú na farmu, kde sa členovia pripravujú na vylúpenie banky.
Scullyová zisťuje, že v Spojených štátoch sa v minulosti tajne pracovalo na vývoji biologických zbraní. Skinner tvrdí, že ten výskum sa už dávno skončil, ale Scullyová má podozrenie, že skupina má patogén z amerických vládnych laboratórií a niekto možno Muldera poslal na samovražednú úlohu. Scullyová si vzápätí uvedomuje, že skupina banku nechce vylúpiť, len chce patogénom kontaminovať peniaze, aby sa nevedome nakazili ďalší ľudia.
S maskami na tvárach Mulder a členovia skupiny vtrhnú do banky. Bremer vstúpi do trezoru a peniaze postrieka patogénom. Skupine sa úspešne podarí utiecť a Mulder si až dodatočne uvedomuje, že skutočným cieľom prepadnutia banky bolo kontaminovať peniaze. Bremer na Muldera vytiahne zbraň a tvrdí, že vie, že ich oklamal. Haley však Bremera preruší, lebo z mikrofilmu zistil, že pravým zradcom vnútri skupiny je práve Bremer. Bremer na to reaguje tak, že všetkým okolo prehrá pásku so záznamom konverzácie medzi Mulderom a Scullyovou. Mulder je odhalený. Bremer Haleymu podá kľúčenku s kľúčmi od auta a povie mu, aby utiekol a viac sa mu neplietol do cesty. Následne Bremer a Holohlavý muž s Mulderom odchádzajú na opustené tiché miesto neďaleko farmy, kde chcú Muldera popraviť. Mulder kľačí na kolenách a zaznie výstrel. Mulder sa pomaly nahne dopredu, akoby ho zasiahla guľka, no vtom vedľa neho na zem padne mŕtve telo Holohlavého muža. Bremer Mulderovi nakáže, aby rýchlo utiekol predtým, ako ich oboch chytia.
Mulder sa teda ponáhľa do banky, v ktorej sú už Scullyová a Skinner, ktorí sa postarali o to, aby boli kontaminované peniaze zaistené. Mulder sa Scullyovej pýta, ako vedela, že skupina vylúpila práve túto banku, keďže všetci mali na hlavách masky. Scullyová mu s úsmevom na tvári prezradí, že Muldera spoznala podľa obväzu, ktorý mu obmotala okolo jeho zlomeného malíčka. Leamus agentom oznamuje, že peniaze preverili, ale boli čisté. Mulder a Scullyová Leamusa obvinia z toho, že všetko vopred naplánoval a že vláde išlo iba o získanie patogénu do svojich rúk. Neskôr Haleyho auto schádza z cesty. Vnútri sedí Haley, ktorého tvár napadol a usmrtil ho patogén, ktorý sa nachádzal v kľúčenke, ktorú mu dal Bremer.