MULDER SPOLU S LIEČITEĽOM JEREMIÁŠOM SMITHOM A MIMOZEMSKÝM LOVCOM V PÄTÁCH ODCHÁDZAJÚ NA FARMU, NA KTOREJ MULDER UVIDÍ PREBIEHAJÚCE PRÍPRAVY NA KOLONIZÁCIU, ZATIAĽ ČO SCULLYOVÁ SA DOZVEDÁ PODROBNOSTI O PROGRAME OČKOVANIA PROTI KIAHŇAM, POMOCOU KTORÉHO SA VLÁDE DARÍ KATALOGIZOVAŤ ĽUDSKÚ POPULÁCIU.
(pokračovanie predchádzajúcej epizódy)
Kanada. Opustená krajina. Opravár sa autom priblíži k stĺpu elektrického vedenia. Pomocou špeciálnej výbavy sa dostane hore a začína s opravou, ale priletí a poštípe ho včela. Opravár ju zaženie a vzápätí vidíme, ako sa pod stĺpom zhromaždí päť identických chlapcov. Opravára chytia neznesiteľné kŕče a padá na zem. Chlapci sa priblížia k umierajúcemu opravárovi. Pozrú sa naňho a potom všetci pomaly a v pokoji odchádzajú tým smerom, ktorým prišli, nechávajúc opravára ležať na ceste napospas osudu.
Mulder, Scullyová a Jeremiáš Smith stoja zoči-voči mimozemskému lovcovi, ktorý prišiel zabiť liečiteľa Smitha. Smith sa dá na útek a mieri do neďalekej opustenej rozľahlej továrenskej budovy, do ktorej vzápätí po ňom vstúpi Mulder, po ňom mimozemský lovec a nakoniec Scullyová. Všetci hľadajú Smitha. Po dlhšom hľadaní prvý Smitha nájde Mulder. Spolu opustia budovu s mimozemským lovcom v pätách. Mulder sa ukryje v kope lístia, prekvapí lovca a svojou mimozemskou dýkou ho bodne do zátylku. Lovcovi z rany vytečie zelená tekutina a lovec padá na zem. Mulder sa drží od tela ďalej, aby sa vyhol účinku lovcovej zelenej toxickej krvi, ale podarí sa mu zmocniť sa lovcovej dýky, pričom svoju nechá v lovcovom zátylku. Spolu s Jeremiášom nasadnú do motorového člna a plavia sa preč. Scullyová márne kričí na Muldera, ktorý ju nepočuje. Nájde telo mimozemského lovca. Rana sa jeho krku sa však sama od seba uzatvorí a lovec prekvapenú Scullyovú chytí za krk a začne ju škrtiť.
Mulder a Jeremiáš zatiaľ na brehu opustia čln. Mulder chce, aby mu Jeremiáš pomohol zachrániť jeho matku, ktorá umiera, ale Jeremiáš sa správne domnieva, že pri Mulderovej matke na nich už čakajú ľudia zo Syndikátu. Jeremiáš neustále hovorí o veľkom pláne a tvrdí, že Muldera zavedie na miesto, kde uvidí svoju sestru a bude mať príležitosť pochopiť to, proti čomu stojí. Mulder sa telefonicky spojí so Scullyovou, aby jej povedal, že so Smithom mieria do Kanady. Nevie však o tom, že so Scullyovou v jej aute sedí aj lovec s dýkou v ruke, ktorý si vypočuje jeho slová a mieri za nimi. Scullyová po jeho odchode Muldera varuje, že Mulder si myslel, že lovca zabil, ale lovec ešte stále žije.
Mulder a Smith cestou narazia na telo mŕtveho opravára, ktoré na ceste ležalo nedotknuté nie viac ako 24 hodín. Jeremiáš Muldera dovedie až k rozhľahlej hospodárskej pôde, ktorá je pokrytá gigantickými čiernymi plachtami. "Pozeráte sa na budúcnosť, pán Mulder," hovorí Jeremiáš Smith. Pod plachtami niekto pestuje kríčky, ktoré by však Mulder nenašiel v žiadnych taxonomických tabuľkách. Smith tvrdí, že ich tu pestujú kvôli peľu. Medzi kríčkami si Mulder všimne malé dievča, ktoré vyzerá presne ako jeho sestra Samantha v spoločnosti chlapca, ktorého sme videli v úvode epizódy. Mulder nerozumie tomu, ako je možné, že Samantha vôbec nezostarla. Je rovnako stará ako tej noci, keď ju uniesli. Jeremiáš mu vysvetľuje, že Samantha a jej druh nevedia rozprávať a predstavujú tu iba obyčajnú pracovnú silu. Prichádzajú k malej osade, v ktorej žije hneď niekoľko dvojíc, ktoré vždy tvorí jedna Samantha a jeden chlapec. Sú to klony, starajú sa o seba bez dozoru rodičov a pestujú tu kríčky. Ale prečo? Predtým, ako Mulder môže dostať odpoveď, sa v osade objaví mimozemský lovec, ktorý ich našiel. Mulder a Smith spolu s jednou Samanthou mieria do včelína, v ktorom sa schovajú. Lovec vstúpi dovnútra a trojica naňho zhodí gigantický včelí plást a včely lovca napadnú, zatiaľ čo trojici sa podarí utiecť.
Scullyová sa zatiaľ vo Washingtone od Skinnera dozvedá, že všetci piati muži, ktorí vyzerajú ako Jeremiáš Smith a pracovali v štátnych službách, sa neukázali v práci. S pomocou agenta Pendrella sa Scullyová dozvedá, že muži v práci na pevných diskoch svojich počítačov zhromažďovali zatiaľ neidentifikované údaje, ktoré nekorešpondujú s ich pracovnou agendou. Je to zjavne nekonečný zoznam písmen a číslic. Scullyová sa podujme zistiť, čo písmená a číslice znamenajú. Prichádza do Mulderovho bytu a na okno nalepí pásky v tvare X. Objaví sa Pán X, ktorý tvrdí, že sledoval Mulderov byt, lebo má preňho dôležitú informáciu týkajúcu sa jeho matky. Tvrdí, že je nechránená a Mulder by mal urobiť všetko preto, aby sa čo najrýchlejšie dostal k nej do nemocnice. Scullyová mu ukáže papier, na ktorom má vytlačené písmená a číslice a žiada ho o pomoc. Pán X jej po istom váhaní nakoniec prezradí, že ide o program očkovania proti kiahňam. "Neotvárajte dvere, cez ktoré nie ste pripravená prejsť, agentka Scullyová," varuje ju Pán X, a so slovami "chráňte matku" opúšťa Mulderov byt. Scullyová v práci Pendrellovi oznamuje, že súbory predstavujú záznamy o očkovaní proti kiahňam. Scullyová síce nevie, prečo by to niekto robil, ale tuší, že ide o zoznam ľudí, ktorí boli zaočkovaní vakcínou proti kiahňam. Do Skinnerovej kancelárie sa jej podarí zvolať niekoľkých členov vedenia a informuje ich o tom, že je dôležité zamerať sa na skutočnosť, že existuje možnosť, že pri očkovaní proti kiahňam boli v rámci očkovania ľudia zaočkovaní genetickým nosičom pripojeným k očkovacej látke a záznamy o tom viedli práve muži zo štátnych služieb. Skinner sa Scullyovej pýta, prečo by nás niekto takto katalogizoval. Scullyová nepozná odpoveď.
Vzápätí jej volá Mulder z telefónnej búdky. Mieri do nemocnice k matke a chce, aby mu Scullyová zaistila ochranu. Mulder však nečakal, že mimozemského lovca sa len tak ľahko nestrasie. Ten sa totiž celý dobodaný od včiel opäť objaví v Mulderovej blízkosti. Mulder chce vymeniť svoj život za život svojej matky. "Všetko umiera," odpovedá mu lovec a hodí Muldera o auto. Mulder upadá do bezvedomia a lovec mieri ku Smithovi a Samanthe.
Neskôr sa Mulder fyzicky aj psychicky na dne konečne objaví v nemocnici, v ktorej leží jeho matka. Scullyová ho zavedie do jej izby, kde sa Mulderovi v očiach objavia slzy. Myslí si, že zlyhal. Scullyová trvá na tom, že pokým jeho matka leží v nemocnici, Mulder sa nesmie vzdávať. Tvrdí, že našla miesto odkiaľ začať. Našla nádej. Tú pre nich predstavuje Pán X, ktorý podľa Scullyovej vie pravdu a môžu ich k nej doviesť. Čo však Scullyová netuší je to, že práve v tejto chvíli Pán X umiera na prahu dverí do Mulderovho bytu potom, ako ho Syndikát odhalil ako zradcu. Jediný odkaz, ktorý po sebe zanecháva, sú krvou napísané písmená na podlahe: "SRSG". Ukáže sa, že je to skratka pre Špeciálneho splnomocnenca generálneho tajomníka OSN. Mulder sleduje stopu, ktorá ho nakoniec dovedie k tajomnej Marite Covarrubiasovej, ktorá najprv tvrdí, že farma, o ktorej jej Mulder povedal, bola zničená a nezostali žiadne dôkazy o žiadnych včelách ani včelínoch, ale nakoniec mu ukáže fotografie, ktoré ukazujú pravý opak. "Nie všetko umiera, pán Mulder," tvrdí Marita a Mulder si pomaly uvedomuje, že našiel novú informátorku. V tom čase do izby pani Mulderovej prichádza mimozemský lovec. V izbe ho už čaká Muž s cigaretou. So slovami "najhorší nepriateľ je človek, ktorý nemá čo stratiť," Muž s cigaretou presvedčí lovca, aby pomocou svojich liečiteľských schopností vyliečil Mulderovu matku.