Ocitáme sa v Iraku začiatkom roku 1991 počas operácie Púštna búrka. Prihovára sa nám bývalý armádny dôstojník Josepho. Vraví, že podobne ako Boh prišiel za pradávnymi prorokmi, tak prišiel i za ním. Bolo to počas nečakaného nepriateľského útoku, kedy v púšti padlo mnoho mužov z jeho jednotky. Vidíme všetko o čom hovorí. Josepho sa snaží pomôcť zranenému druhovi zo svojej skupiny. Vojnové peklo všade okolo. Josepho vraví, že jednotka si držala svoje pozície a útoku by odolali, no sám mal v ten deň predtuchu, že umrú. Náhle sa ozve výbuch bomby, ktorá ich pevnosť premení na hromadu trosiek. Všetci z jednotky okrem Josepha prichádzajú o život. Josepho vraví, že po jeho mužov si prišla smrť, no on prežil. Vtom sa z rozvíreného prachu okolo vynoria štyria muži, štyria žoldnieri a zaútočia na nepriateľov. Ocitnú sa zoči-voči nepriateľskej paľbe, guľky ich však nezastavia a štvorica neohrozene postupuje ďalej. Josepho cituje Bibliu a vraví, že prišli štyri bytosti a mali podobu štyroch hrdinov. Paľba utíchne a štyria bojovníci prejdú okolo zraneného Josepha ležiaceho na zemi a kráčajú preč. Porazili nepriateľa a vyhrali. Josepho nám povie, že vedel, prečo ho ušetrili: aby šíril posolstvo o Božích synoch. Posolstvo od Boha, ktorý tu bol ako prvý pred všetkými ostatnými bohmi. Keď tak vraví ocitneme sa v prítomnosti. Kamera sa začne oddaľovať od Josephovej tváre a my vidíme, že stojí na vrchu vesmírnej lode ležiacej v podzemnej komore v Kanade.

Námestník Brad Follmer bol medzičasom poverený velením pátraciemu tímu, ktorý má nájsť Scullyovej uneseného syna Williama. Agentom z pátracej jednotky zhrnie okolnosti únosu a z jeho slov sa dozvedáme, že Osamelí strelci sa práve z fotiek snažia identifikovať ženu, ktorá Williama uniesla. Nasleduje strih do miestnosti, v ktorej Strelcom na monitore počítača ukazujú fotky možných páchateliek. Nakoniec dôjde i na fotku tej pravej, ktorá Williama uniesla, no Strelci mlčia. Nasleduje strih späť do zasadačky, v ktorej Follmer agentom oznámi, že Doggett leží v nemocnici a upadol do kómy. V rovnakej nemocnici v kritickom stave leží i agent Comer. Uvidíme, že v zasadačke ho počúvali i Scullyová so Skinnerom. Scullyová teraz miestnosť opúšťa a chodbou kráča preč. Skinner kráča za ňou a pýta sa jej čo tu robí - veď sem vôbec nemusela chodiť. Scullyová namieta, že vo Follmerovi vidí len muža, ktorý zadržiava informácie a už dvakrát sa mu nepodarilo zabrániť útoku na jej syna. Sama je presvedčená, že celé Follmerovo pátranie je len a len o tom ako si nepriznať pravdu. Skinner jej vraví, že Follmera ani Kersha nemôže z ničoho viniť a že obaja ju chránili tým, že jej nepovedali o správach o tom, že Mulder už nežije, čo však Scullyová považuje len za systematické úsilie ako sa ich s Mulderom zbaviť. Skinner sa ju snaží presvedčiť, že je na jej strane, no Scullyová sa obráti a kráča preč. Skinner sa jej pýta kam ide. "Nájsť svojho syna," odpovedá Scullyová.

Skinner odchádza do nemocnice, v ktorej leží Doggett. V jeho izbe nájde Reyesovú, ktorá práve Doggetta držala za ruku a teraz sa zamýšľa nad tým či ich Doggett môže počuť. Skinner jej povie, že na niečo podobné myslel i vo Vietname: i ak by nás tí, za ktorých sa modlíme nepočuli, tak Boh možno počuje. Reyesovej volá Scullyová a stretnú sa v Scullyovej byte. Tam jej Scullyová povie, že vie, kto jej vzal syna. Reyesovej ukáže fotku ženy, ktorá Williama uniesla a vraví, že žena je členkou UFO-kultu. V byte u Scullyovej sú i Osamelí strelci a Scullyová ich požiadala, aby o tom, že ženu identifikovali nikomu nehovorili - ani FBI. Byers do Williamovej sedačky do auta predtým ako ho žena uniesla schoval mobilný telefón. Teraz sa snažia vystopovať jeho signál. Scullyová Reyesovú presvedčí, že nemá na výber a musí konať na vlastnú päsť. FBI by sa jej nezdráhala oznámiť, že si myslia, že William je už po smrti a pátraniu bude koniec. Strelcom sa zatiaľ podarilo vystopovať signál a agentky po stope signálu odchádzajú do Pennsylvánie.

Žena, ktorá Williama uniesla medzičasom volá Josephovi a oznámi mu, že Williama má so sebou a je v bezpečí. Josepho po ňu pošle svojich ľudí. Ďalší členovia kultu sa práve snažia otvoriť vrchnú časť vesmírnej lode. Nevedia prečo, ale spodná kruhovitá časť lode sa z ničoho nič začne pohybovať a jej vrchná časť do svojho vnútra uzavrie dvoch mužov stojacich pod jej záklopkami. Scullyová a Reyesová zatiaľ prichádzajú k ženinmu autu. Je však prázdne, vnútri nájdu len Williamovu sedačku.

Reyesová opäť prichádza do nemocnice za Doggettom, no keďže ho práve vzali na rádiológiu Reyesová kráča do nemocničnej kaplnky, aby sa za Doggetta pomodlila. Tam k nej pristúpi Follmer a je prekvapený tým, že ju tu vidí modliť sa. Povie jej, že to od nich so Scullyovou bolo hlúpe, že po podozrivej šli na vlastnú päsť. FBI tam mohla byť skôr a podozrivú by už dávno zadržali. Follmer sem Reyesovú prišiel požiadať o spoluprácu. On osobne jej zatiaľ nič nezatajil. Povie jej, že Comer sa prebral a chce im niečo povedať. Spolu odchádzajú do Comerovej izby. Comer je napojený na dýchací prístroj a keďže nemohol hovoriť to, čo chcel povedať napísal. Follmer odkaz ukáže Reyesovej. Je to na papieri napísané slovo "kabát". Follmer chce vedieť čo tým Comer chcel naznačiť. Reyesová nevie, ale odkaz neskôr ukáže Scullyovej. Tá chvíľu váha, no Reyesovej nakoniec prezradí, že Comer tým myslí svoj kabát, vo vrecku ktorého Scullyová našla artefakt. Spolu odchádzajú do nemocnice a Scullyová artefakt podrží ponad Comerovým telom. Ten sa vplyvom liečivej energie preberie a schmatne artefakt, no Scullyová ho nepustí a pevne ho zviera vo svojej dlani. Reyesovej povie, aby vypla prístroje, aby personál nemocnice nezistil, že Comer sa prebral. Comer nakoniec artefakt pustí a Scullyová mu dýchaciu trubicu vytiahne z úst. Comer Scullyovej pod nátlakom prezradí, že Boh vodcu kultu Josepha doviedol k mimozemskej lodi, ktorej časť Scullyová drží vo svojej ruke. Josepho verí, že loď je domovom fyzickej podoby Boha. Prostredníctvom symbolov na povrchu mimozemskej lode sa dozvedel o proroctve o zázračnom dieťati, záchrancovi budúcnosti, po ktorom dychtia sily Dobra i Zla. Tým dieťaťom je Scullyovej syn. Josepho sa však bojí toho, že William bude nasledovať svojho otca v tom, že sa mimozemšťanom postaví na odpor. Proroctvo značí, že Mulder musí umrieť, lebo inak by svojho syna mohol presvedčiť, aby sa vzoprel svojmu osudu a postavil sa na stranu odboja proti tým, ktorých má viesť. Comer si myslí, že Mulder je už dávno po smrti a zabili ho preto, aby naplnili proroctvo. A on sám Williama teraz po Mulderovej smrti chcel zabiť preto, aby na to nedoplatilo celé ľudstvo a nedošlo k mimozemskej invázii, ktorej má William stáť na čele. Comerovi sa ťažko dýcha a Scullyovú požiada o artefakt. Otvoria sa dvere do izby a dovnútra vstúpi zdravotná sestra spolu s mužom z vedenia FBI. Comer Scullyovej artefakt uchmatne z ruky. Muž z FBI Scullyovú i Reyesovú požiada, aby z izby vystúpili na chodbu.

Žena, ktorá uniesla Williama prichádza do Kanady na miesto vykopávok. Keď s Williamom v náručí pristúpi k mimozemskej lodi jej spodná časť sa opäť rozhýbe a otvorí sa i jej vrch. Vnútri ležia spálené telá dvoch mužov, ktorí zostali uzavretí vo vnútornej komore.

Muž z FBI, ktorý dáva pozor na Comera do nemocnice zavolal Follmera so Skinnerom. Scullyová s Reyesovou zatiaľ čakajú v kaplnke. Reyesová Scullyovú uisťuje, že nielen jej dieťa, ale ani žiadné iné si nezaslúži umrieť. Žiadne náboženstvo na svete neuznáva usmrtenie dieťaťa, ale mnohé na druhú stranu varujú pred falošnými prorokmi ... i falošnými proroctvami. Reyesová Comerovým slovám neverí a je presvedčená, že William stále žije a že artefaktom môžu vyliečiť i Doggetta. Prichádza Skinner a agentkám dá vedieť, že Comer práve umrel. Reyesová sa ponáhľa do jeho izby a od sestričky chce vedieť čo sa stalo. Sestrička to nevie, ale vidí sa jej, že Comera zabili Scullyová s Reyesovou tak, že ho odpojili od prístrojov. Reyesová zisťuje, že artefakt je preč. Scullyová medzitým prekĺzla do Doggettovej izby, chytí ho za ruku a prihovára sa mu. Doggett sa preberie a Scullyovej povie, že počul niečí hlas - a nebola to Scullyová. Do izby vstúpi Reyesová. Doggett Scullyovej povie, že za ňou prídu, ale ona im nesmie uveriť. Práve v tej chvíli Scullyovej zazvoní jej mobilný telefón. Volá jej Josepho.

Dohodnú sa na stretnutí v reštaurácii v Kanade. Josepho jej povie, že Williama chce len uchrániť pred tými, ktorí by mu ublížili. Cituje verš z Biblie a vraví, že Biblia opisuje velikánov, ktorí kráčajú po zemi a uveria jej len veriaci a tí, čo uvideli božích bojovníkov - pravých "Božích synov", tak ako ich opisuje Sväté písmo. Jej syn sa narodil preto, aby bol vodcom tejto mimozemskej rasy superžoldnierov (to preto replikanti Williama potom ako sa narodil nezabili). Josepho Scullyovej povie, že k synovi ju dovedie len v tom prípade, ak mu ona poskytne dôkaz, že Mulder je po smrti. Ak žije je jediným, kto stojí v ceste Williamovmu pravému osudu. Scullyová sa Josepha pýta či Muldera zabil. Josepho vraví, že nie, ale veril tomu, že Mulder už nežije, ibaže teraz má dôvody o tom zapochybovať. Scullyová chce vidieť svojho syna. Josepho ju však núti k tomu, aby si vybrala - buď prežije Mulder alebo William. S tým odchádza preč. Vonku sa už schovávajú Reyesová a Osamelí strelci. Frohike Josephovi na auto pripojil prístroj, ktorým ho môžu sledovať. Scullyová a Reyesová nasadnú do auta a Osamelí strelci ich navigujú kam majú ísť. Josepho dorazí ku svojej skupine. Žena zo skupiny mu povie, že William sa rozplakal a s loďou sa začali diať divy. Scullyová s Reyesovou prichádzajú na koniec cesty. Scullyová v diaľke uvidí biely stan. Rozbehne sa k nemu. Z lode vyžiari jasné svetlo a osvieti celé okolie. Josepho pristúpi ku svetlu a vstúpi dovnútra lode, kým ostatní stoja okolo. Scullyová a Reyesová vidia, že stan, ktorý zakrýval miesto vykopávok začne horieť a klesne na zem. Vesmírna loď sa vznesie ponad zem a agentky vidia ako pomaly odlieta preč. Všade okolo ležia telá členov kultu spálené od radiácie. Scullyová po chvíli začuje detský plač. Williama nájde ležať na zemi zabaleného do deky. Ani ona ani Reyesová netušia prečo, ale William bol jediným, komu sa nič nestalo. Scullyová svojho syna zodvihne a objíme ho.

Doggett sedí v nemocničnej kaplnke, keď k nemu podíde Reyesová. Doggett jej povie, že sa k nemu prihováral hlas, ktorý mu hovoril, aby vstal a aby varoval Scullyovú. Reyesovej sa pýta či to bol jej hlas. Ona mu povie, že sa len modlila za jeho život a Doggett sa zahľadí na kríž pred sebou.

Follmer v Ústredí FBI kvôli správe o úmrtí agenta Comera prichádza za Kershom. Skinner ju nepodpísal, lebo si myslí, že Comera zavraždili. Follmer ju na druhú stranu podpísal, lebo nenašiel nič čo by potvrdzovalo Skinnerovo obvinenie. To však už nie je pravda, keďže Follmer zistil, že prístroje napojené na Comera detailne zaznamenali jeho stav a je z nich zrejmé, že tesne predtým ako ho od prístrojov odpojili sa jeho stav zlepšoval. Follmer to nevie vysvetliť, no svoje meno chce zo správy vyškrtnúť. Kersh ho napomenie, aby si viac hľadel na vyšetrovanie namiesto toho, aby spätne menil svoje názory.

Kersh potom vstúpi do svojej pracovne. Správu o prípade so slovami, že sa zdá, že je po všetkom okrem tohto prípadu podá mužovi z vedenia FBI, ktorý zabil Comera. Muž poznamená, že sa o to postará. Kamera nám ukáže mužov zátylok, na ktorom uvidíme tmavý výbežok. Vieme, čo to znamená.